Praėjus dvejiems metams po to, kai keturi bebaimiai kovotojai Mikelandželas, Donatelas, Leonardas ir Rafaelis nugalėjo piktadarį Šrėderį ir atnešė taiką bei ramybę Niujorkui, įtampa mieste vėl ima didėti. Užuosdami kažką negero, vėžliukai ima aiškintis situaciją ir atranda, kad...
Filmas atkuria sukrečiančius rugsėjo 11-osios teroristų atakos įvykius. Du lėktuvai tądien rėžėsi į Pasaulio prekybos centrą, vienas – į Pentagoną. Ši istorija – apie tai, kas nutiko ketvirtąjame teoristų užgrobtame lėktuve.
